FUNDAMENTAL II (6º ao 9º ano): Atendendo a alunos de 11 (onze) a 14 (quatorze), o Ensino Fundamental II Colégio IPAE, proporciona a seus educandos condições de desenvolvimento das suas habilidades de observação, interpretação, julgamento e conclusões próprias, despertandoo espírito crítico, analítico e transformador. Para tanto, conta com uma equipe de profissionais qualificados e preparados tanto para o ensino acadêmico como social e espiritual. Além das disciplinas da base comum, oferece em seu currículo: espanhol e música, além do canto-coral como atividade extracurricular. No desenvolvimento da proposta pedagógica, os processos de ensino e de aprendizagem, fundamentam-se nas teorias e práticas pedagógicas, levando em consideração três momentos relevantes: a socialização, a individualização e a interação. Para os interessados, este segmento oferece condições de atendimento nos residenciais – ou seja, caráter residente.